1.緩沖液的鹽濃度必須小于 500 mM。
2.建議使用保護柱。不能使用強堿性物質作為流動相添加劑或者溶解樣品，因為這樣會損壞填料中的硅膠成分。
3.流動相pH>7.0時，溫度必須在5°C到25°C之間。
4.不能使用pH>8.0的磷酸緩沖液。當需要使用pH >9.0的緩沖液時，使用硼酸緩沖液。
5.推薦用乙腈開始分析。
有機溶劑改性劑的洗脫能力按以下順序遞減:
乙腈>乙醇>甲醇: 50%CHzCN # 65-70%EtOH # 75-80%MeOH
其它有機溶劑沒有做過使用研究，所以可能會對色譜柱造成損壞。
由于乙醇的粘度比較高，所以使用乙醇時會比乙腈產生高的多的反壓。
6.選擇流動相配比時，推薦使用水(緩沖液) /乙腈50:50 (v/v)作為初始流動相。
如果樣品保留時間太短或者太長，可以降低或者提高乙腈的含量。
乙腈含量的微小變化可能會造成樣品保留時間的明顯變化。
流動相在使用前需要用0.5um濾膜過濾，以清除固體顆粒。
降低溫度可能會改善選擇性。
升高溫度同時降低流速可能會提高分辨率。
7.流動相中有機溶劑的含量過高會導致流動相中鹽份析出，導致色譜柱堵塞。
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